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有些物种的基因注释比较缺乏,映射为近缘物种再进行下游分析的时候,有可能效果还会更好一点。比如说把小麦基因映射为拟南芥的同源基因,再进行下游的GO、KEGG富集分析,结果会更丰富。
biomaRt
可以提供这样的操作。
另一个是KEGG的SSDB数据库:https://www.genome.jp/kegg/genes.html
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有些物种的基因注释比较缺乏,映射为近缘物种再进行下游分析的时候,有可能效果还会更好一点。比如说把小麦基因映射为拟南芥的同源基因,再进行下游的GO、KEGG富集分析,结果会更丰富。
biomaRt
可以提供这样的操作。
另一个是KEGG的SSDB数据库:https://www.genome.jp/kegg/genes.html